南安普敦大学由八个学部组成，学部下设学院，于2010年创设至今，并有三个系和几个独立分院，目前主要结构为:
- 商学，法学与艺术学部
- 商学
- 法律
- 温彻斯特艺术学院
- 工程与环境工程学部
- 土木与环境工程
- 工程科学
- 声音与震动研究所
- 健康科学学部
- 健康科学
- 职能治疗
- 物理治疗
- 足部治疗
- 人文学部
- 考古学
- 英语
- 电影研究
- 历史
- 现代语言
- 音乐
- 哲学
- 医学部
- 南安普敦医学院
- 补充医学研究单位
- 自然环境与科学学部
- 生物科学
- 化学
- 海洋与地球科学
- 国家海洋科学中心
- 物理科学与工程学部
- 电子与计算机科学
- 物理和天文学
- 光电子研究中心
- 人文社会与数学科学学部
- 教育学
- 地理与环境学
- 数学
- 心理学
- 社会科学
- 南安普敦统计科学研究所
- 当代中国中心
- ESRC – 博士培训中心